自从中东乌拉圭的遗迹调查设施天国之门的大爆炸，或是说xx(Twin x)以后已经過了十几年。Twin x可以说是历史上最大的灾难。在那以后的世界，因为天空被封闭的镜“Sheltering Sky”所覆蓋，地磁场变得异常，以电脑为主的电子仪器全都不能使用，人类回到了以前的时代的生活。被认定为Twin xx的主犯的圆輝道博士的子女——龙也和紀世子承受着世间的嘲讽，同时，又肩负着母亲死后遗留下來的庞大的债务，过着逃避债主的生活。直到一个下雨天，二个人在街上的西式建築碰到了三个青年，命运的軸轮终于开始转动，将他們带向不可知的未來……Twin xx爆发真正的原因是什么？天国之门又是什么？圆博士和GILGAMESH，露加和伯爵夫人的真意是什么？各种各样的迷团冒出來，关系着世界命运的战斗，被操纵，究竟会去向何方？
回复 :目暮警官、小兰的母亲妃英里、阿笠博士接连遭到不明身份之人的暗算。柯南追踪伤害阿笠博士的凶手，他根据几起案件现场留下的线索发现凶手按照扑克牌的顺序行凶，而且遇害者皆与毛利小五郎有关。目暮提供的线索初步揭开事情的真相，原来毛利当年任职警察的时候曾经逮捕犯下杀人罪的赌徒村上丈，当年也更因这一事件导致毛利离职以及婚姻变故。十年后，服刑期满的村上丈出狱，开始按照扑克牌的顺序向毛利身边之人展开报复。在得知原委后，毛利努力寻找身边与数字有关的人。在这一过程中，各种惊险场面接连出现。而柯南也对案件的真相产生疑惑……
回复 :北岛玛雅（胜生真沙子 配音）是一个各方面看都很普通的少女，她家境贫穷，和母亲蜗居在店铺街的小二楼里。可是，一旦站到了舞台上，玛雅就会绽放出耀眼的光芒。无论什么样的剧本，只要看过一遍，就会牢牢记住其中的台词，拥有着这样能力的玛雅被当红明星月影千草（中西妙子 配音）相中了，玛雅加入了月影老师所在的月影剧团。初涉演艺界的玛雅获得了巨大的成功，同时也认识了另一剧团的樱小路优（三矢雄二 配音）。为了演出经典剧目《红天女》，一场明争暗斗在玛雅和同行姬川亚弓（松岛美野里 配音）之间展开。最终玛雅获得了演出资格，而她和速水真澄（野泽那智 配音）以及樱小路优之间的感情也在缓慢的发酵着。
回复 :一年一度的七夕即将到来，东京、神奈、静冈、长野等地却接连发生六起连环杀人案，被害者身边皆留下麻将牌中的七筒和奇怪暗示。由于作案范围过大，各地警署探员纷纷聚到东京警署的专案组共同研究案情，毛利小五郎也被邀请参加，柯南则偷偷听取了会议的内容。会后，柯南无意中听到群马县警部山村操哼唱的童谣，继而发现有黑衣组织的成员混进警察中间。在一次围捕行动中，柯南遇到假扮人质的Vermouth，得知近期一连串的杀人案件与存有组织内部人员资料的记忆卡有关。与此同时，潜入警察内部的间谍偷偷盗取工藤新一和柯南的指纹，新一的身份眼看被拆穿，巨大的危险正向他和身边的人急速袭来……
