故事发生在一个名为楢崎町的小镇上，亚洲永久这是一个拥有着神秘魔法力量的神奇小镇，亚洲永久在小镇的天空中，永远都挂着一道绚丽的彩虹，而在传说中，神明会实现居住在这个小镇里的人们每人一个愿望。天海春彦（泰勇气 配音）是从小到大都生活自镇上的青年，一天，班上来了一个名为深峰莉子（清水爱 配音）的转校生，让春彦没有想到的是，这个女孩竟然是自己的义妹，他们在年龄很小的时候分开了，想不到命运的红线令两人于此时此刻重逢。莉子的出现让春彦的青梅竹马木之坂雾乃（宫崎羽衣 配音）感到了强烈的危机感，她一直默默的喜欢着春彦。
回复 :东京、大阪、京都相继发生杀人事件，5名死者皆是被头戴面具的黑影人用武士刀和弓箭瞬间杀害。警方介入调查，发现死者都是出没于3地专门偷窃有名的佛像及美术品的偷盗集团“源氏萤”成员。该集团共有成员8名，以义经的家臣名字互相称呼，且都持有一本《义经记》，被害5人手中的《义经记》均被拿走。这日京都古寺山能寺收到奇怪书信，说若能解开信中所附的画谜，便能找到8年前被窃的如来佛像。柯南、小兰随毛利小五郎来到该寺，均对画谜一筹莫展。5名被杀者之一曾对与新一不相上下的大阪高中生服部平次照料有加，服部也来到京都对案件秘密展开调查，并借机找寻自己的初恋情人。柯南与服部相遇联手调查时，发现有人想置服部于死地，紧接“源氏萤”另一成员被害，而这一切，似乎又都与画谜有关。
回复 :少女彭涞在旅游中误入一个神秘的洞窟，里面藏着中华古籍《山海经》。彭涞好奇地取下《山海经》来阅读，不料因此解开了书本的封印，山海经中的各种奇妖异兽从书中跑了出来。为了平息这场骚动、并将山海经还原，彭涞踏上了回收山海兽的旅程。山海兽们跑出书本后，在世界各地肆意捣乱，闹得城市鸡飞狗跳。彭涞巡游各地，努力回收各个动物。鸟兽们自然不愿意乖乖返回经书，每次双方都要经过一番战斗。回收的山海兽可以供彭涞召唤并借用其能力，其中一部分山海兽更是变成了可靠的伙伴。最后彭涞成功回收了全部山海兽，挽救了现实世界，回到父母身边的彭涞变得更加坚强自信。
回复 :坂东晴希（米内佑希 配音）曾经渴望成为一名柔道运动员，然而随着对这项运动的深入了解，晴希渐渐发现，自己也许永远都无法参透其中的精髓了。于是，晴希选择了放弃。桥本一马（冈本信彦 配音）是晴希青梅竹马的玩伴，看到晴希消沉的模样，一马组建了独一无二的男子拉拉队“BREAKERS”，邀请晴希加入。就这样，晴希进入了一个前所未知的新世界。和晴希一起的，还有性格非常严厉，但穿衣品味风格异常糟糕的德川翔（小野友树 配音）、虽然体格现状，但毫无运动细胞的沟口涉（杉田智和 配音）、重量级选手，想要通过跳啦啦操来减肥的远野浩司（林勇 配音）。
