双子の姉妹エレインとダイアナは、假面生まれながらにして生体エネルギー“ヴァジュラ”の力を秘めていた。2人の精神が融合する時、假面超生命体“ジェノサイバー”が誕生した。 いま、ジェノサイバーと人類との半世紀にわたる戦いが始まる。