某天，香蕉柯南因感冒在家休息，香蕉期间接到了灰原哀的电话。原来灰原做出了APTX-4869的最新解药，虽然只是试制品，但一心恢复工藤新一身份的柯南仍然迫不及待赶往阿笠博士的实验室。服药后，新一终于回到原有状态，不过周遭的一切却似乎有所改变：博士院子里的树长高了，出现许多新的建筑物，体育老师变得苍老，班里的同学全是陌生面孔，甚至元太、光彦和步美也都变成高中生的模样。他找到同样变成高中生的灰原，得知自己在过去的10年里不断服用解毒药导致产生抗药性，最近5年已无法变会原有状态。失落的柯南无奈看着周遭的转变，更让他倍受打击的是，小兰决定放弃杳无音讯的新一而嫁给新出老师。他们的恋情亦梦以幻，何以为终……
回复 :这是一个阿鼠与阿狼的冒险故事，阿鼠是任务执行人，而阿狼则是“任务协会”的中介，专门为阿鼠寻找任务。在二人不停的完成各种艰难的任务的同时，阿鼠透露出对某种不可名状事物的向往——“星辰大海”；而阿狼，也在各种任务中寻找家族消失的线索。二人从任务中得知在除了现在这个世界，还有一个“上面的世界”，且各种迹象表明，阿鼠的向往，和阿狼寻找的线索，都直指“上面的世界”，甚至“更上面的世界”。
回复 :少女彭涞在旅游中误入一个神秘的洞窟，里面藏着中华古籍《山海经》。彭涞好奇地取下《山海经》来阅读，不料因此解开了书本的封印，山海经中的各种奇妖异兽从书中跑了出来。为了平息这场骚动、并将山海经还原，彭涞踏上了回收山海兽的旅程。山海兽们跑出书本后，在世界各地肆意捣乱，闹得城市鸡飞狗跳。彭涞巡游各地，努力回收各个动物。鸟兽们自然不愿意乖乖返回经书，每次双方都要经过一番战斗。回收的山海兽可以供彭涞召唤并借用其能力，其中一部分山海兽更是变成了可靠的伙伴。最后彭涞成功回收了全部山海兽，挽救了现实世界，回到父母身边的彭涞变得更加坚强自信。
回复 :小兰的朋友原子家铃木财团准备展出他们家珍藏的沙皇尼古拉二世家的宝物——回忆之卵，回忆之卵里收藏了沙皇尼古拉二世一家的珍贵照片，由此特别珍贵。岂料在展出之前，却收到了怪盗基德的通知函，上面用迷语的方式列明他盗宝的时间。原子找到小兰的爸爸名侦探毛利小五郎帮忙，当然，真正的幕后高手柯南也会和小兰一起前来。柯南遇到了同为侦探的服部平次，两人决定一起联手解开怪盗基德之谜！
