某天，制服柯南因感冒在家休息，制服期间接到了灰原哀的电话。原来灰原做出了APTX-4869的最新解药，虽然只是试制品，但一心恢复工藤新一身份的柯南仍然迫不及待赶往阿笠博士的实验室。服药后，新一终于回到原有状态，不过周遭的一切却似乎有所改变：博士院子里的树长高了，出现许多新的建筑物，体育老师变得苍老，班里的同学全是陌生面孔，甚至元太、光彦和步美也都变成高中生的模样。他找到同样变成高中生的灰原，得知自己在过去的10年里不断服用解毒药导致产生抗药性，最近5年已无法变会原有状态。失落的柯南无奈看着周遭的转变，更让他倍受打击的是，小兰决定放弃杳无音讯的新一而嫁给新出老师。他们的恋情亦梦以幻，何以为终……
回复 :逢泽驱（三瓶由布子 配音）和逢泽杰（福山润 配音）是血浓于水的亲兄弟，两人之间的感情非常的要好。阿杰拥有着杰出的运动天赋，是日本少年队里的王牌选手。阿驱虽然也对足球有着非凡的热爱，但童年时代的经历让他不愿意在别人的注视下踢球，而是选择在夜晚无人的公园里反复练习。升入高中后，阿杰顺理成章的加入了足球部，而阿驱则成为了足球部的经理，以左膀右臂的身份支持着哥哥。在一场严重的交通事故中，阿杰和阿驱双双身受重伤，在这性命攸关的紧要关头，为了救弟弟，阿杰选择将自己的心脏移植给了阿驱，从此之后，阿驱背负上了阿杰的遗志。
回复 :根岸崇一（岸尾大辅 配音）是一个老实巴交的青年，怀揣着对于未来的希冀，他只身一人来到东京念大学。崇一非常的热爱音乐，尤其是流行乐，他最大的梦想就是可以抱着吉他，将自己喜欢的歌唱给更多的人听。为了出人头地，崇一参加了新人音乐家招募的活动，哪知道在误打误撞之中加入了名叫“Detroit Metal City”的恶魔系重金属乐队，成为了其中的骨干。崇一在脸上涂抹古怪的油彩，违心的以嘶吼的方式唱着狂野劲爆的歌，哪知道他的表演竟然意外的大受好评，很快，崇一就在重金属摇滚圈里出了名。崇一暗恋着名为相川由利（长泽雅美 配音）女孩，糟糕的是，相川最讨厌的就是重金属了，为了成就自己小小的恋情，崇一处心积虑的想要隐瞒自己大大的秘密。
回复 :阳光明媚的一天，柯南（高山南 配音）、小兰（山崎和佳奈 配音）以及少年侦探团的伙伴们随同毛利小五郎（小山力也 配音）来到大阪，参加在当地举行的“高中生皋月杯”百人一首和歌大赛。期间，他们还见到了彼此的好友服部平次（堀川亮 配音）和远山和叶（宫村优子 配音）。就在比赛进行中途，一封爆炸预告信送到电视台，警方迅速行动起来组织疏散。疏散一半时，爆炸突然发生，结果平次与和叶被困在建筑物中。而在一连串的混乱过后，一位皋月杯相关人员的尸体突然出现在众人面前。迷离的案情再度引起柯南的注意……本片根据青山刚昌的超人气漫画改编，系“名侦探柯南系列”第21部电影版。
